Après un master d’études audiovisuelles à Toulouse, Bénédicte Pagnot s’installe en Bretagne. Pendant quelques années, elle est assistante de réalisation, régisseuse et chargée de casting.

Son premier court-métrage La Petite Cérémonie date de 2001 (il est sélectionné dans une vingtaine de festivals et primé par huit). Depuis elle alterne la réalisation de documentaires et de fictions.

En 2013 sort au cinéma son premier long-métrage de fiction Les Lendemains (prix du public du festival Premiers Plans d’Angers et prix d’interprétation féminine pour Pauline Parigot au festival du cinéma d’auteur de Rabat, Maroc). Son premier long-métrage documentaire : Islam pour mémoire, Un voyage avec Abdelwahab Meddeb, doublement primé au Festival International du Cinéma Méditerranéen de Tétouan (Maroc) sort au cinéma en 2017.

Sa dernière réalisation est une mini-série : Si je veux (3×40 minutes). Cette série a été en compétition au Festival de la Fiction de La Rochelle 2025. Elle est visible sur la plateforme france.tv jusqu’en septembre 2026.

En parallèle de son activité d’autrice-réalisatrice, Bénédicte Pagnot partage sa pratique et son expérience dans le cadre de formations ou d’ateliers avec des publics très divers.